Inspektorat Jenderal Kementerian Agama memiliki beragam aplikasi yang digunakan untuk memberikan kemudahan baik dalam pelaksanaan tugas dan fungsi instansi maupun dalam memberikan pelayanan prima bagi masyarakat. Beberapa aplikasi yang dimaksud, terdapat pada website Inspektorat Jenderal Kementerian Agama yaitu http://itjen.kemenag.go.id, diantaranya e-konsultasi yang menyediakan Formulir Registrasi Pemohon Layanan, SIRANDANG atau Sistem Informasi Perundang-Undangan, Informasi Pelayanan Publik oleh PPID Itjen Kemenag, dan Simdumas atau Sistem Informasi Manajemen Pengaduan Masyarakat yang merupakan integrasi pengelolaan pengaduan masyarakat (dumas) dan whistleblowing system. Pada Agustus 2022, Inspektorat jenderal Kementerian Agama juga melakukan uji publik terhadap aplikasi Ampuh. Aplikasi ini merupakan akronim dari Analisis Mengenai Produk Hukum yang terintegrasi dengan website Itjen Kementerian Agama. Selain itu, terdapat juga Sistem Kehadiran Pegawai dan SITU atau Sistem Informasi Tata Usaha yang digunakan untuk penomoran surat menyurat di Itjen Kemenag. Di website Itjen Kemenag tersebut juga terdapat layanan SAKIP yang memuat Laporan Kinerja, Rencana Strategis, dan surat edaran terkait.