Namun, masih terlihat bahwa penerapan EMIS pada lingkupmadrasah belum optimal. Melihat lebih rinci, belum optimalnya penerapan EMIS dilihat dari segi data lembaga yang tidak sesuai dengan kondisi riil.Hal ini mempengaruhi akurasi data EMIS. Dampaknya data EMIS tidakdapat digunakan menjadi informasi yang tepat guna dan terpercaya. Saatini, EMIS tengah melakukan revitalisasi dan pengembangan yang diberinama EMIS 4.0 untuk menghadirkan sistem yang lebih baik dan lebihhandal dengan didukung oleh teknologi yang lebih mutakhir serta beberapaterobosan baru.