Tugas LPMQ ialah menyelenggarakan pentashihan, pengkajian,
penerbitan dan pengawasan Al-Qur’an berdasarkan kebijakan teknis
yang ditetapkan oleh Kepala Badan Litbang dan Diklat. Sebagaimana
yang diamanatkan juga dalam PMA No. 3 Tahun 2007. Dalam hal ini
LPMQ juga mempunyai tupoksi yaitu melakukan pengawasan Al-Qur’an cetak maupun digital. Salah satu isu atau permasalahan yang ditemui dalam pelaksaan pengawasan Al-Qur’an digital ialah belum optimalnya pengawasan tersebut dan belum adanya pedoman praktis (guideline) terkait pengawasan tersebut. Hal ini menimbulkan sistem pengawasan Al-Qur’an digital yang kurang baik. Beberapa dampak buruk dari kurang optimalnya proses pengawasan Al-Qur’an digital ialah banyaknya kesalahan secara teknis maupun substansi pada Al-Qur’an digital, mengaburkan umat islam dalam proses pembacaan dan penghafalan Al-Qur’an, dapat menyesatkan umat islam.